Диагностика идиопатического мегаколона следующая — при ректороманоскопии и колонофиброскопии находят расширение прямой кишки, которая без видимой границы переходит в дилатированную сигмовидную кишку (отличие от болезни Гиршпрунга). Локализация процесса, степень удлинения или расширения кишки уточняются во время ирригографии (скопии).
