Общая картина взаимодействия вируса с клеткой, вырисовывающаяся при анализе результатов исследований, выглядит следующим образом.
Эклипс
В результате контакта между вирусной частицей и чувствительной клеткой наблюдается серия реакций, ведущих к появлению внутри клетки, свободного генетического материала вируса. Следовательно, в этот момент инфицирующие вирионы перестают существовать как организованные структуры. Поскольку инфекционность генетического материала вируса, т. е. его свободной нуклеиновой кислоты, как правило, во много раз меньше инфекционности цельной вирусной частицы, освобождение вирусного генома и введение его внутрь клетки-хозяина сопровождается уменьшением или исчезновением инфекционности. Инфекционность не обнаруживается в течение так называемого скрытого периода инфекции. Это явление, наблюдаемое при любой вирусной инфекции, получило название эклипса, а период, в течение которого отсутствует инфекционность, периода эклипса.
Репликация вирусов
Истинные вирусы никогда не репродуцируются так, как клетки, е. путем увеличения их размеров, сопровождающегося делением. Размножение вирусов происходит путем репликации генетического материала. Основные события, имеющие место при репликации вирусов, происходят на том же биохимическом уровне, что и репликация макромолекулярных компонентов клетки, обладающих генетической непрерывностью, т. е. нуклеиновых кислот и органелл клетки.
Проникновение нуклеиновой кислоты вируса в клетку в процессе ее заражения может происходить различными путями. Так, у фагов этот процесс, т. е. освобождение ДНК и ее последующая инъекция сквозь оболочку бактериальной клетки, происходит непосредственно на поверхности этой клетки сразу же после прикрепления к ней фага. В других случаях в результате взаимодействия внешней оболочки вируса с плазматической мембраной в цитоплазму клетки сначала целиком проникает внутренний капсид вируса, и лишь затем происходит освобождение генома, т. е. нуклеиновой кислоты, от белков капсида. При некоторых других вирусных инфекциях, например при заражении клеток вирусом осповакцины, сначала весь вирион, прикрепившийся к поверхности клетки, окружается выпячивающейся клеточной мембраной, в результате чего этот вирион в конце концов оказывается внутри клеточной вакуоли. Дальнейший процесс освобождения вирусной нуклеиновой кислоты идет при активном участии самого вируса, индуцирующего образование в клетке ферментов и активаторов ферментов, необходимых для депротеинизации вирусной нуклеиновой кислоты. Несколько вирионов в одной клетке могут активно кооперироваться при осуществлении этих процессов.
Как только вирусный геном—носитель генетической информации вируса — освободится от белка, он может быть использован, во-первых, для репликации и, во-вторых, для индукции биосинтеза специфических соединений. Репликация, однако, начинается лишь в том случае, если предварительно выполнены соответствующие условия, для чего может потребоваться осуществление ряда этапов. Одним из таких условий является достижение вирусным геномом соответствующего участка клетки. Например, у одного из миксовирусов, а именно у вируса гриппа, ранняя стадия репродукции происходит в ядре, что, вероятно, вызвано специфическими условиями освобождения вирусной РНК из нуклеокапсида. Часто предварительным условием репликации является образование в клетке новых ферментов. Например, для того чтобы началась репликация ДНК вируса оспы (этот процесс происходит в цитоплазме клетки-хозяи- на), необходимо, чтобы сначала синтезировались ферменты, катализирующие синтез ДНК. Было показано, что «фабрики», производящие цельные вирионы вируса оспы, также образуются в цитоплазме. Близкая по характеру ситуация имеет место при синтезе ДНК некоторых фагов. Было показано, что для синтеза ДНК таких фагов необходим ряд ферментов, отсутствующих в незараженной бактерии-хозяине, в связи с чем в этих случаях обязательным условием синтеза фаговой ДНК является предварительная индукция синтеза этих ферментов.
Удивительная ситуация возникает при репродукции РНК-содержащих вирусов, требующей предварительного синтеза специфических и идентичных РНК-репликаз. Имеются убедительные доказательства, что репродукция многих РНК-содержащих вирусов происходит без предварительного образования ДНК-реплики. Так, например, было показано, что ингибирование синтеза ДНК не оказывает какого-либо отрицательного действия на репродукцию РНК-содержащих вирусов. С помощью метода отжига было также установлено, что РНК вирусов, по- видимому, не обнаруживает гомологии в отношении к ДНК клетки-хозяина.
До сих пор в незараженных клетках не были обнаружены ферменты, способные катализировать независимый от ДНК синтез РНК. Имеются веские основания полагать, что такой процесс существовать не может. Поэтому можно прийти к выводу, что в клетках, зараженных РНК- содержащими вирусами, синтез ферментов, необходимых для репликации вирусной РНК (РНК-репликаз), генерируется самими вирусами.
Очевидно, что в упомянутых выше случаях вирусный геном должен обеспечить стимул, а часто и структурную генетическую информацию, требуемую для биосинтеза новых ферментов. Если вирус содержит достаточно большое количество генетического материала, то возможность выполнения им подобной совокупности функций представляется вполне реальной. Например, крупные фаги и вирионы вирусов группы оспы содержат количество ДНК, вполне достаточное для кодирования синтеза полипептидных цепей пятидесяти, а быть может, и большего числа различных белков. Интересный вопрос возникает, однако, в связи с репродукцией наиболее мелких вирусов, ДНК или РНК которых имеют молекулярный вес порядка 106 далътон. Генетическая информация, содержащаяся в таких вирусах, в состоянии обеспечить синтез лишь очень небольшого числа белков. Поскольку одна аминокислота (средний молекулярный вес аминокислот составляет примерно 110 даль- тон) кодируется тремя нуклеотидами (молекулярный вес трех нуклеотидов составляет примерно 1000 дальтон, а трех нуклеотидных пар — 2000 дальтон), отношение молекулярного веса нуклеиновой кислоты к молекулярному весу кодируемого ею белка для одноцепочечных ДНК или РНК равно 9 : 1, а для двухцепочечной ДНК— 18:1. Следовательно, реализация комплекса функций, выполняемых в клетке-хозяине такими мелкими вирусами, зависит от активности очень небольшого числа генов.
В качестве примера крайней ситуации, при которой нуклеиновая кислота вируса содержит крайне незначительное количество генетической информации, можно привести репродукцию вируса-сателлита вируса некроза табака, фактически представляющего собой «субвирус». РНК этого вируса-сателлита состоит всего из 1200 нуклеотидов, а характерный для него капсид построен из белковых субъединиц, каждая из которых состоит из 400 аминокислотных остатков. Очевидно, что количество генетической информации, содержащейся в РНК этого вируса- сателлита, не превышает необходимой для синтеза его капсида, а для какой-либо дополнительной информации в РНК этого вируса просто не остается места! Следовательно, либо при репродукции данного вируса функцию РНК-репликазы выполняет белок капсида, либо эту функцию выполняют какие-то иные компоненты, доставляемые в клетку извне. И действительно, этот вирус является «паразитом», или сателлитом, другого РНК-содержащего вируса — вируса некроза табака, обладающего, по-видимому, неспецифической РНК-репликазой.
Как только в клетке возникают благоприятные условия, вирусная нуклеиновая кислота начинает реплицироваться. Иногда репликацию удается выявить по косвенным признакам. Одним из таких признаков является, например, эктопическое образование ДНК, имеющее место, в частности, при размножении вирусов группы оспы, происходящем, как известно, в цитоплазме. Однако непосредственным доказательством такой репликации является увеличение содержания в клетке экстрагируемой инфекционной нуклеиновой кислоты или нуклеиновой кислоты, обладающей специфическим химическим составом, характерным для данной вирусной нуклеиновой кислоты. Впрочем, вирусная нуклеиновая кислота, находящаяся в репликативной форме, по своей структуре действительно может отличаться от нуклеиновой кислоты, выделяемой из вирионов. Так, например, фаги, в вирионах которых содержится одноце почечная ДНК, при репродукции индуцируют образование двухцепочеч ных структур, служащих промежуточной репликативной формой. У некоторых фагов линейная молекула ДНК вириона при репродукции в клетке-хозяине превращается в молекулу, имеющую форму замкнутого кольца, или индуцирует образование длинных цепей ДНК.
Несмотря на то что возникновение контактов между несколькими копиями нуклеиновой кислоты одного и того же или родственных вирусов может привести к генетической рекомбинации, вирусный геном в процессе размножения вируса не распадается на отдельные фрагменты. Результаты, полученные при изучении генетических рекомбинаций у фагов и вирусов животных, показывают, что последовательность расположения генетических детерминантов в вирусном геноме сохраняется, даже если’ и имеет место некоторая реорганизация, аналогичная наблюдаемой нами в генетическом материале высших организмов (делеции, инверсии и даже перенос генов клетки-хозяина в геном вируса). И действительно, включение генома фага в геном клетки-хозяина, наблюдаемое у лизогенных бактерий, представляет собой один из примеров генетической перестройки.
Согласно одному из наиболее важных обобщений, вирусная нуклеиновая кислота во время репликации не связывается со специфическими белками или иными веществами, содержащимися в зрелых вирионах. В самом деле, бурная репликация вирусной нуклеиновой кислоты может иметь место даже в том случае, когда биосинтез белка полностью предотвращен, например при действии химических ингибиторов биосинтеза белка. Обычно, когда биосинтез белков капсида только начинается, репликация вирусной нуклеиновой кислоты уже давно находится в полном разгаре. Благодаря синтезу этих белков накапливается фонд предшественников, служащих источником материала, используемого при сборке капсида. Образование капсида является, по-видимому, конечной стадией процесса в том смысле, что вновь синтезированная нуклеиновая кислота, заключенная в капсид, внутри той же клетки, как правило, не освобождается. Следовательно, при сборке капсида вирусный геном удаляется из реплицирующейся популяции. Внешние оболочки в тех случаях, когда они имеются у вириона, присоединяются к капсиду позднее, что происходит часто при физическом контакте капсида с внутриклеточными мембранами или с плазматической мембраной клетки.
В один и тот же капсид или внешнюю оболочку вируса могут включаться белки, детерминированные геномами различных вирусов. Это явление было названо фенотическим смешиванием. В результате фенотического смешивания образуются частицы, у которых специфичность, определяемая белками вириона, отличается от специфичности содержащегося в них генома.
Созревание вируса
Комплекс явлений, ведущих к включению вирусного генома в капсид и к завершению формирования вириона, называется созреванием.
Конечным этапом репродукции вируса является либо лизис клетки-хозяина, сопровождаемый выходом полностью сформированных вирионов во внешнюю среду, либо выталкивание вируса во внешнюю среду вместе с частью цитоплазмы, либо, наконец, выход из клетки единичных вирионов или небольших их групп. Вместе с целыми вирусными частицами во внешнюю среду могут выходить как не полностью сформированные вирионы, так и их отдельные компоненты. Вся совокупность событий, ведущих к образованию зрелых вирионов и выходу их во внешнюю среду, называется продуктивным циклом. Некоторые вирусы животных с трудом выделяются из клетки во внешнюю среду. Выход таких вирусов из клеток и их распространение по организму хозяина осуществляется благодаря захвату фагоцитами убитых вирусом клеток и их перевариванию.